中医药人工智能系创建于2020年6月，主要负责人工智能本科专业的建设和面向全校各专业的中医药人工智能通识教育体系的建设，以及协助实验中心建设人工智能实验室、智能医学实验室、人工智能创新工作室、智能医学创新工作室等。目前有高级职称4人，讲师4人，具有博士学位8人，硕士生导师3人。
中医药人工智能系负责建设的课程团队有：人工智能导论课程团队、机器学习课程团队、自然语言处理课程团队、模式识别与计算机视觉课程团队、知识表示与推理课程团队、数字信号处理课程团队、智能医学概论课程团队、医院智慧服务信息系统课程团队、移动开发课程团队等。
自2020年以来，中医药人工智能系教师团结协作、积极进取，获得了中国商业联合会科学技术奖一等奖两项，第三届江苏省本科高校青年教师教学竞赛省级二等奖，第九届全国青年科普创新实验暨作品大赛省级二等奖，第六届青年教师教学竞赛校级一等奖。
本系老师指导学生获得了挑战杯黑科技国家级三等奖、计算机设计大赛国家级二等奖两项和三等奖一项、“互联网+”大学生创新创业大赛省级二等奖和三等奖，“挑战杯”省级二等奖，江苏省普通高等学校本专科优秀毕业论文（设计）省级三等奖，蓝桥杯大学生软件信息技术与人才大赛国家级和省级奖项等。
教师近四年发表论文50多篇，其中SCI论文3篇，EI论文6篇，北大中文核心5篇。获得发明专利1项，软著10项。获立国家自然科学基金青年项目、教育部产学合作协同育人项目、江苏省智慧中医药健康服务工程研究中心项目、江苏省高校自然科学基金项目、江苏省高校哲学社会科学研究一般项目、江苏省重点教材项目等多项。